Аннотация: Помощь студентам в подготовке к экзамену по биохимии - часть словаря по курсу биохимии.
С Л О В А Р Ь П О Т Е М Е " Б И О О К И С Л Е Н И Е " .
1. О К И С Л Е Н И Е - это отщепление от вещества электронов.
Примечание - электроны чаще всего отщепляются в составе атомов водорода.
"Оттягивание" электронной плотности от атома (например, присоединенным атомом кислорода) тоже является окислением атома.
2. В О С С Т А Н О В Л Е Н И Е - это присоединение электронов.
Примечание - присоединение атомов водорода тоже является восстановлением (вещества, к которому эти атомы водорода присоединились).
3. С О П Р Я Ж Е Н И Е окисления и восстановления - слово сопряжение означает, что если одно вещество окисляется, то обязательно есть такое, которое восстанавливается за счет окисления первого (принимая электроны, отщепленные от первого).
4. Биологическое окисление ( Б И О / О К И С Л Е Н И Е ) - это окислительно-восстановительные процессы в живых организмах.
5. К О С В Е Н Н О Е О К И С Л Е Н И Е - это так называемое окисление кислородом воды (то есть атомом кислорода, который входит в состав молекулы воды).
6. Приставка "Д Е" (реже - "дез") - это указание на то, что группа (или атомы, или молекулы), название которой звучит после приставки, отщепляется.
Например, дегидратация - это отщепление воды. Дегидрирование - это отщепление водорода. И т.д..
7. Г И Д Р О Г Е Н И У М - это водород.
8. Д Е Г И Д Р И Р О В А Н И Е - это отщепление атомов водорода.
9. Г И Д Р А Т А Ц И Я - это присоединение молекулы воды.
10. 3 Э Т А П А косвенного окисления -
1) дегидрирование (отщепление атомов водорода), при котором образуется двойная связь,
2) гидратация (присоединение молекулы воды по образовавшейся на предыдущем этапе двойной связи),
3) второе дегидрирование, при котором тоже образуется двойная связь.
Процессы, в которых встречается косвенное окисление - ЦТК, окисление этанола, -окисление (жирных кислот).
11. А Т Ф - аббревиатура (сокращенное обозначение) АденозинТриФосфата. Роль АТФ - основная форма конвертируемой энергии.
12. А Д Ф - аббревиатура (сокращенное обозначение) АденозинДиФосфата. Образуется при синтезе АТФ и при расщеплении АТФ.
13. В И Т А М И Н Ы - это органические вещества, которые не образуются в организме. Но необходимы для нормального существования организма.
Поэтому витамины должны поступать с пищей (с теми видами пищи, в которых витамины содержатся). Иначе развиваются различные патологии, а полное отсутствие витамина (авитаминоз) приводит к смерти. Пример - цинга.
Примечание - витамин Д может синтезироваться в организме. Но при условии, что на кожу человека попадают солнечные лучи (УФЛ). (Но и избыток солнечных лучи вреден для организма, особенно для кожи).
14. К О Ф Е Р М Е Н Т Ы - это органические вещества, которые необходимы для работы ферментов в качестве переносчиков атомов и функциональных групп.
Строго говоря, коферменты связаны с апоферментом (полипептидной цепью, белковой частью фермента) непрочно, а если бы были связаны прочно, то такие вещества следовало бы называть простетическими группами. Но часто коферментами называют и простетические группы.
В состав коферментов входят водорастворимые витамины (есть пример и с жирорастворимым витамином К).
Короткое определение кофермента - это непрочносвязанные органические кофакторы. Или - это небелковая часть фермента (но не любая, а органическая и, строго говоря, непрочносвязанная)).
15. В О С С Т А Н О В Л Е Н Н Ы Е К О Ф Е Р М Е Н Т Ы (= восстановленные формы коферментов) - так называют коферменты, выполняющие функцию переноса атомов водорода, ПОСЛЕ того, как к ним присоединили переносимые атомы водорода.
Примеры восстановленных форм коферментов - ФАДН2, НАДН, Н+.
16. О К И С Л Е Н Н Ы Е К О Ф Е Р М Е Н Т Ы (окисленные формы коферментов) - так называют коферменты, выполняющие функцию переноса атомов водорода, ДО того, как к ним присоединили переносимые атомы водорода.
Примеры окисленных форм коферментов - ФАД, НАД+.
17. Н А Д + - это кофермент, окисленная форма. (Плюс означает, что есть положительный заряд).
Полное название - Никотинамид/Аденин/Динуклеотид.
Функция - как и все коферменты, участвует в реакциях переноса групп (групп атомов);
на НАД+ переносятся атомы водорода (точнее, 2 электрона и протон, а протон второго атома водорода остается в среде), отщепленные от субстратов ферментами подкласса "дегидрогеназы" (что характерно для катаболических процессов);
а НАД+ переносит атомы водорода в ДЦ (для выработки 2, 5 АТФ).
Никотинамид, который входит в состав НАД+, является витамином, обозначается РР (против пеллагры - противопеллагрический).
18. Н А Д Ф + - это кофермент, окисленная форма.
Полное название - никотинамид/аденин/динуклеотид/фосфат.
Функция - как и все коферменты, участвует в реакциях переноса групп (групп атомов);
на НАДФ+ переносятся атомы водорода (точнее, 2 электрона и протон, а протон второго атома водорода остается в среде), отщепленные от субстратов процесса, который называется ПФП (ферментами подкласса "дегидрогеназы");
а НАДФ+ выполняет роль ДОНОРА атомов водорода в реакциях, в которых атомы водорода присоединяются к субстратам (что характерно для анаболических процессов).
Никотинамид, который входит в состав НАДФ+, является витамином, обозначается РР (против пеллагры - противопеллагрический).
19. Н А Д Н , Н+ - восстановленная форма кофермента НАД+.
Образуется после "принятия" атомов водорода, отщепленных от субстратов.
Является основным субстратом для ДЦ (Р/О = 2,5).
Никотинамид, который входит в состав НАДН, Н+, является витамином, обозначается РР (против пеллагры - противопеллагрический).
20. Н А Д Н Ф , Н+ - восстановленная форма кофермента НАДФ+.
Образуется в реакциях процесса ПФП (в основном).
Используется в качестве донора атомов водорода, которые должны присоединиться к субстратам.
Никотинамид, который входит в состав НАДФН, Н+, является витамином, обозначается РР (против пеллагры - противопеллагрический).
21. Ф А Д - это кофермент, окисленная форма.
Полное название - флавин/аденин/динуклеотид/фосфат.
Функция - как и все коферменты, участвует в реакциях переноса групп (групп атомов);
на ФАД переносятся атомы водорода (точнее, 2 электрона и 2 протона), отщепленные от сукцината и некоторых других субстратов (ферментами подкласса "дегидрогеназы");
а ФАД (как и НАД+) переносит атомы водорода в ДЦ (для выработки 1,5 АТФ).
РибоФлавин, который входит в состав ФАД, является витамином, обозначается В2.
У ФАД есть другие функции, о которых сказано далее.
22. Ф А Д Н 2 - восстановленная форма кофермента ФАД.
Образуется после "принятия" атомов водорода, отщепленных от субстратов.
Является субстратом для ДЦ (Р/О = 1,5).
23. - А З Ы - это окончание означает название фермента. Бывают исключения: транслоказа - транспортный белок, а пепсин и трипсин, плазмин - ферменты, хоть и без окончания -аза.
24. К А Т А Б О Л И З М - процессы превращения веществ в более простые. "Распады".
25. А Н А Б О Л И З М - процессы превращения веществ в более сложные. "Синтезы".
26. С В О Б О Д Н О Е О К И С Л Е Н И Е - окислительные процессы, не связанные (напрямую) с синтезом АТФ.
(Все окислительные процессы, кроме окислительного фосфорилирования)
27. И О Н - заряженная частица.
28. Г Е М - соединение иона железа и порфиринового кольца.
29. Г Е М О П Р О Т Е И Н Ы - белки (протеин - это синоним белка), для работы которых необходим гем.
Примеры гемсодержащих белков - гемоглобин (в эритроцитах, транспортирует кислород), миоглобин (в мышцах, хранит кислород), цитохромы ДЦ и цитохром Р 450 и другие.
Как правило, гемсодержащие белки работают с кислородом.
30. О К С И Д О Р Е Д У К Т А З Ы - это название класса ферментов, которые катализируют окислительно-восстановительных реакции.
31. Р Е Д У К Т А З Ы - это ферменты класса оксидоредуктаз, которые катализируют присоединение атомов водорода к молекуле субстрата.
Донором атомов водорода служит при этом кофермент НАДФН, Н+ (а для переноса атомов водорода от НАДФН, Н+ к субстрату необходим кофермент ФАДН2).
Сокращенно - редуктазы присоединяют водород.
32. Д Е Г И Д Р И Р О В А Н И Е - это отщепление атомов водорода.
33. Д Е Г И Д Р О Г Е Н А З Ы - это ферменты класса оксидоредуктаз, которые катализируют отщепление атомов водорода от молекулы субстрата.
При этом отщепленные от молекулы атомы водорода переносятся на кофермент НАД+, который превращается при этом в НАДН, Н+. Или (реже) - на кофермент ФАД, который превращается при этом в ФАДН2.
Сокращенно - дегидрогеназы отщепляют водород, который переносится на коферменты.
34. О К С И Д А З Ы - это ферменты класса оксидоредуктаз, которые, как и дегидрогеназы, катализируют отщепление атомов водорода, но, в отличие от дегидрогеназ, переносят атомы водорода не на коферменты, а на молекулу кислорода, превращая молекулу кислорода в перекись водорода.
Сокращенно: оксидазы - это ферменты, которые отщепляют атомы водорода, которые переносятся на кислород.
Нужно знать такие разновидности оксидаз, как МАО и КсО, и для чего применяются ингибиторы этих ферментов.
35. К О Ф Е Р М Е Н Т О К С И Д А З - это кофермент, который необходим для работы оксидаз.
Коферментом оксигеназ является ФАД, он используется оксидазами в качестве промежуточного переносчика атомов водорода. То есть сначала атомы водорода переносятся оксидазами от субстрата на ФАД (превращая ФАД в ФАДН2), а от ФАДН2 - на молекулу кислорода.
36. О К С И Г Е Н А Ц И Я - это присоединение атома кислорода. (Источником атомов кислорода служит при этом молекула кислорода.)
37. О К С И Г Е Н А З Ы - это группа ферментов класса оксидоредуктаз, которые катализируют присоединение атомов кислорода к молекуле субстрата (то есть катализируют процессы оксигенации). Используя в качестве источника атомов кислорода молекулу кислорода.
Сокращенно - оксигеназы присоединяют кислород.
38. М О Н О О К С И Г Е Н А З Ы - это оксигеназы, которые катализируют присоединение одного (приставка "моно" - один) атома кислорода (к молекуле субстрата).
При этом атом кислорода оказывается в составе образовавшейся (при его присоединении) -ОН (гидроксильной) группы.
Монооксигеназы относятся к ферментам свободного окисления.
39. Д И О К С И Г Е Н А З Ы - это оксигеназы, которые катализируют присоединение обоих атомов молекулы кислорода (к молекуле субстрата).
При этом субстрат, к которому присоединились оба атома кислорода, превращается в органическую перекись.
Диоксигеназы относятся к ферментам свободного окисления.
40. Г И Д Р О К С И Л А З Ы - это синоним монооксигеназ (обусловленный тем, что при работе монооксигеназ образуется гидроксильная группа).
41. К О Ф Е Р М Е Н Т Ы О К С И Г Е Н А З - это коферменты, которые необходимы для работы оксигеназ. К коферментам оксигеназ относятся аскорбат и НАДФН.
42. А С К О Р Б А Т - аскорбиновая кислота (ее анион или соль), витамин С.
43. Ц И Т О Х Р О М Ы - группа ферментов класса оксидоредуктаз, которые катализируют перенос электронов.
Необходимо знать, что цитохромы есть в ДЦ и есть цитохром Р 450.
ЦИТОХРОМ Р 450 - нужно знать, что этот фермент участвует в обезвреживании ксенобиотиков (катализирует реакции первой фазы метаболизма ксенобиотиков)
и в реакциях эндогенного метаболизма.
44. К С Е Н О Б И О Т И К И - вещества, которые не образуются в организме и не нужны для жизнедеятельности данного организма.
Сокращенно - экзогенные вещества, не нужные для жизнедеятельности.
45. М А О - аббревиатура МоноАминОксидаз.
МАО участвует в разрушении гормонов, без которых человек не может ощущать радость, счастье. (И некоторых других гормонов).
Поэтому ингибиторы МАО применяются при лечении эндогенных депрессий (эндогенных - то есть не связанных с неприятностями в жизни, а обусловленных нарушением действия гормонов головного мозга.)
46. К с О - сокращение КсантинОксидазы.
КсО катализирует образование мочевой кислоты, поэтому ингибиторы КсО применяются с целью уменьшения образования мочевой кислоты при лечении подагры и при вторичной гиперурикемии (для предупреждения почечной недостаточности).
47. К А Т А Б О Л И З М - это процессы превращения сложных соединений в более простые.
48. А Н А Б О Л И З М - это процессы превращения более простых соединений в более сложные.
49. 1-Й Э Т А П К А Т А Б О Л И З М А - см. деполимеризация.
50. 2-Й Э Т А П К А Т А Б О Л И З М А - см. унификация мономеров.
51. 3-Й Э Т А П К А Т А Б О Л И З М А - см. ЦТК и ДЦ.
52. М О Н О М Е Р - это вещество, которое может вступать в реакцию с такими же или похожими молекулами, образуя соединения из двух и более мономеров (точнее - из остатков мономеров, так как в процессе образования связей с другими мономерами мономер теряет некоторые атомы).
Примеры самых важных мономеров - глюкоза, аминокислоты, нуклеотиды.
53. П О Л И М Е Р - это соединение из нескольких мономеров (точнее, из остатков мономеров; обычно - не менее нескольких десятков).
Примеры самых важных полимеров - гликоген, белки, ДНК и РНК.
54. Г И Д Р О Л И З - это способ расщепления связей с присоединением молекулы воды при расщеплении.
55. Г И Д Р О Л А З Ы - это название класса ферментов, которые катализируют реакции гидролиза.
Коротко - гидролазы - это ферменты, которые гидролизуют.
Подкласс гидролаз, которые катализируют гидролиз гликозидных связей (в углеводах), называется гликозидазами.
Подкласс гидролаз, которые катализируют гидролиз пептидных связей (в белках), называется пептидазами.
Подкласс гидролаз, которые катализируют гидролиз фосфодиэфирных связей (в ДНК и РНК), называется нуклеазами.
Подкласс гидролаз, которые катализируют гидролиз сложноэфирных связей с остатками жирных кислот (в липидах), называется липазами.
Коротко - гидролазы - это ферменты, которые гидролизуют.
56. Д Е П О Л И М Е Р И З А Ц И Я - это процесс превращения полимеров в мономеры.
В результате расщепления определенных связей между мономерами. Обычно - путем гидролиза (исключение - фосфоролиз гликогена), ферментами класса гидролазы.
Происходит в ЖКТ и в лизосомах, в основном. (Исключение - расщепление жировых капель в клетках жировой ткани, расщепление гранул гликогена, расщепление белков в протеасомах).
Процессы деполимеризации считаются первым этапом катаболизма.
57. Д Е П О Л И М Е Р И З А Ц И Я Б Е Л К О В - это расщепление белков до аминокислот (протеолиз);
путем гидролитического расщепления пептидных связей между аминокислотными остатками ферментами подкласса пептидазы.
58. Д Е П О Л И М Е Р И З А Ц И Я У Г Л Е В О Д О В - это расщепление углеводных полимеров (крахмала и гликогена);
путем гидролитического расщепления гликозидных связей между глюкозными остатками.
Исключение - расщепление гликогена в печени и мышцах происходит путем фосфоролиза (то есть при расщеплении связей присоединяется не молекула воды, а молекула ортофосфорной кислоты).
59. Д Е П О Л И М Е Р И З А Ц И Я Д Н К и Р Н К - это расщепление ДНК и РНК до нуклеотидов.
60. Д Е П О Л И М Е Р И З А Ц И Я Ж И Р О В - это расщепление молекулы жира на глицерин и жирные кислоты (липолиз).
Путем гидролитического расщепления сложноэфирных связей между остатком глицерина и остатками жирных кислот (то есть ацилами).
Но, строго говоря, молекула жира не является полимером в том смысле, в каком полимером является белок. А деполимеризация жиров не является деполимеризацией в том смысле, в каком - деполимеризация белков.
61. У Н И Ф И К А Ц И Я М О Н О М Е Р О В - это процессы превращения мономеров в метаболиты ЦТК.
Считается вторым этапом катаболизма.
К процессам унификации мономеров относятся такие процессы, как гликолиз, -окисление (жирных кислот), окисление глицерина, переаминирование и дезаминирование аминокислот.
Слово унификация означает уменьшения разнообразия. При унификации мономеров, которых более 20-ти, образуется всего 6 метаболитов ЦТК, то есть действительно происходит уменьшение разнообразия.
Есть еще понятие унификация углеводов - это превращение в глюкозу фруктозы и галактозы.
62. Г Л И К О Л И З - это в переводе значит "расщепление глюкозы",
при этом (при гликолизе) глюкоза превращается в лактат, если условия анаэробные, а если условия аэробные, то в пируват, который поступает в ЦТК, с помощью которого превращается в СО2.
Второй этап катаболизма углеводов.
63. - О К И С Л Е Н И Е - так называется процесс превращения жирных кислот в молекулы АцетилаКоА
(более длинный вариант определения - расщепление углеродной цепи жирной кислоты на двухуглеродные молекулы АцетилаКоА).
Второй этап катаболизма жиров (наряду с окислением глицерина).
64. П Е Р Е А М И Н И Р О В А Н И Е - это процесс, в результате которого происходит замена аминогруппы аминокислоты на кетогруппу (для этого аминокислота должна вступить в реакцию с кетокислотой, чаще всего - с -кетоглутаратом).
Один из процессов второго этапа катаболизма. Относится ко второму этапу катаболизма белков.
65. Д Е З А М И Н И Р О В А Н И Е - это процесс, в результате которого происходит отщепление аминогруппы в виде аммиака, при этом на месте аминогруппы появляется кетогруппа.
Один из процессов второго этапа катаболизма. Относится ко второму этапу катаболизма белков.
66. Ц И КЛ Т Р И К А Р Б О Н О В Ы Х К И С Л О Т (цикл Кребса) - циклический процесс, включающий 8 реакций.
Первой реакцией считается образование цитрата из ацетилаКоА и оксалоацетата. А последней реакций считается образование оксалоацетата из малата.
При этом атомы углерода ацетилаКоА отщепляются от промежуточных метаболитов ЦТК в виде СО2. А атомы водорода отщепляются от промежуточных метаболитов (от четырех) и переносятся на коферменты
(для переноса атомов водорода коферментами в ДЦ с целью выработки основного количества АТФ, способом окислительного фосфорилирования).
Относится к третьему этапу катаболизма - так называемая первая фаза третьего этапа. Является общим этапом для катаболизма углеводов, жиров, белков - то есть всех классов сложных органических веществ, кроме нуклеиновых кислот.
67. Д Ы Х А Т Е Л Ь Н А Я Ц Е П Ь - это процесс переноса атомов водорода (их протов и электронов - но протоны переносятся не до конца ДЦ) от коферментов НАДН, Н+ и ФАДН2 (восстановленных форм коферментов) на кислород (на молекулу кислорода, О2).
68. 1-Я Ф А З А 3-ГО Э Т А П А К А Т А Б О Л И З М А - это ЦТК.
69. 2-Я Ф А З А 3-ГО Э Т А П А К А Т А Б О Л И З М А - это ДЦ.
70. П Д Г ( =П Д Г К ) - аббревиатура ПируватДегидроГеназного комплекса - комплекса ферментов, которые катализируют дегидрирование пирувата и еще ряд реакций, в результате которых пируват превращается в ацетилКоА.
71. П Р Е Д Д В Е Р И Е Ц Т К - эта реакции, которые катализирует ПДГ, в результате которых происходит превращение пирувата в ацетилКоА.
72. О Б О Р О Т Ц Т К - это один цикл реакций, то есть от образования цитрата (из оксалоацетата и ацетилаКоА) в первой реакции до образования оксалоацетата в последней (восьмой реакции).
Примечание - при одном обороте ЦТК происходит полное разрушение одной молекулы ацетилаКоА, которая присоединилась к оксалоацетату в первой реакции.
73. К А Т А Б О Л И Ч Е С К И - Э Н Е Р Г Е Т И Ч Е С К А Я Р О Л Ь Ц Т К - эти слова означают, что ЦТК участвует в катаболизме (завершает катаболизм) и в выработке энергии (АТФ).
74. З А В Е Р Ш Е Н И Е К А Т А Б О Л И З М А У Г Л Е Р О Д Н Ы Х С К Е Л Е Т О В В ЦТК - эти слова означают, что в реакциях ЦТК происходит разрушение двухуглеродной молекулы ацетилаКоА до двух одноуглеродных молекул СО2 - что считается завершением распада углеродных скелетов многих веществ (так как ацетилКоА образуется в результате катаболизма углеводов, жиров и белков).
75. У Ч А С Т И Е Ц Т К В В Ы Р А Б О Т К Е Э Н Е Р Г И И - заключается в том, что за счет одного оборота ЦТК образуется 10 молекул АТФ
(одна молекула АТФ образуется способом субстратного фосфорилирования и 9 молекул АТФ образуются способом окислительно фосфорилирования, за счет переноса коферментами атомов водорода от метаболитов ЦТК в ДЦ).
Следует знать, что с помощью ЦТК образуется основное количество АТФ. Из этого следует, что прекращение работы ЦТК приводит к смерти клеток, которым нужно много АТФ (нейроны и другие), а снижении работы ЦТК - к слабости, вялости, быстрой утомляемости и другим симптомам.
Чтобы ЦТК работал хорошо, нужны
1) хорошие гены, которые кодируют ферменты, катализирующие реакции ЦТК,
2) субстраты пищи или резервных веществ организма (гликоген, жир),
3) витамины в питании,
4) НЕпоступление в организм этанола (так как при метаболизме этанола образуется НАДН, который ингибирует ЦТК),
5) питание полноценными белками, так как они содержат незаменимые аминокислоты для синтеза ферментов ЦТК. И другие факторы.
76. Д Е Г И Д Р И Р О В А Н И Е И П О С Т А В К А В О Д О Р О Д А В Д Ц - это значит, что от метаболитов ЦТК отщепляются атомы водорода (по паре атомов водорода), которые переносятся в ДЦ в составе коферментов (которые называются после присоединения к ним переносимых атомов водорода восстановленными).
При этом атомы водорода переносятся 3 молекулами кофермента НАД+, и одна пара атомов водорода - коферментом ФАД.
За счет поставки в ДЦ атомов водорода каждой из трех молекул НАДН, Н+ образуется 2,5 молекулы АТФ (2,5*3=7,5), а за счет поставки в ДЦ атомов водорода каждой молекулой ФАДН2 образуется 1,5 молекулы АТФ.
77. С У Б С Т Р АТ Н О Е Ф О С Ф О Р И Л И Р О В А Н И Е В ЦТК - так называют образование ГТФ и АТФ за счет одной из реакций ЦТК (подробнее о субстратном фосфорилировании - далее).
78. А Н А Б О Л И Ч Е С К А Я Р О Л Ь Ц Т К - это роль, заключающаяся в том, что образующиеся в реакциях ЦТК метаболиты могут использоваться для анаболизма, то есть для реакций синтеза других веществ.
Например,
1) из оксалоацетата может синтезироваться глюкоза (без чего невозможно прожить больше суток без пищи);
2) из оксалоацетата и -кетоглутарата - аминокислоты, в основном для синтеза белков организма (антител, мышечных и т.д.);
3) из сукцинилКоА - порфирины для гема;
4) из ацетилКоА - липиды (в том числе жирные кислоты для липидов мембран и запасного жира).
Из этого ВЫВОД (по поводу нарушения анаьолической функции ЦТК) -
1) при снижении активности ЦТК возможен дефицит глюкозы в крови при голодании свыше нескольких часов (что приводит к слабости, ухудшению самочувствия, а в крайнем случае - к обмороку, гипогликемической коме и смерти);
2) без достаточной активности ЦТК снижется синтез аминокислот для белков организма, в результате чего - дефицит антител (снижение иммунитета), снижение деления леток (снижение роста, заживления), снижение синтеза мышечного белка (дистрофия мышц),
79. Р Е Г У Л Я Т О Р Н А Я Р О Л Ь Ц Т К - это роль, заключающаяся в том, что образующиеся в реакциях ЦТК метаболиты могут регулировать активность других процессов. См. регуляторные метаболиты ЦТК.
Регулировать другие процессы могут такие метаболиты ЦТК, как цитрат, ацетилКоА и НАДН.
80. О Б Щ И Й П У Т Ь К А Т А Б О Л И З М А - так называют иногда последовательное протекание ПДГ-реакции и ЦТК. Так как большинство веществ (за исключением жирных кислот с четным количеством атомов углерода и некоторых аминокислот) действительно проходит через реакции ПДГ и ЦТК.
(А жирные кислоты с четным количеством атомов углерода и некоторые аминокислоты превращаются в ацетилКоА без участия ПДГ. Таким образом, в их катаболизме этапом, который одинакова с катаболизмом других соединений, является только ЦТК).
81. П И Р У В А Т - это анион трехуглеродной монокарбоновой кетокислоты.
То есть - в этом веществе три углерода, включая углерод карбоксильной группы (которая в клетке при рН около 7 диссоциирована, то есть существует в виде аниона), и один углерод (второй) связан двойной связью с атомом кислорода.
Является субстратом для получения ацетилаКоА и оксалоацетатов - то есть метаболитов, с взаимодействия которых начинается ЦТК. Образуется, в основном, из глюкозы в процессе гликолизе. (А также - из аланина и других аминокислот.)
82. А Ц Е Т И Л К о А - это соединение ацетила (остатка уксусной кислоты) и кофермента А, соединенных сложноэфирной связью (которая в этом случае является макроэргической). Уксусная кислота - это СН3СООН; а ацетил - это СН3 СООН без ОН атомов карбоксильной группы.
83. О К С А Л О А Ц Е Т А Т - это анинон ацетоуксусной кислоты, у которой 4 С, 2 группы -СООН, одна кетогруппа (при С 2).
84. Ц И Т Р А Т - это анион лимонной кислоты.
В лимонной кислоте 6 атомов углерода, три карбоксильных группы (две "по краям" и одна присоединена к третьему атому углерода) и одна гидроксильная группа (в третьем положении).
85. И З О Ц И Т Р А Т - так называют соединение, которое отличается от цитрата положением гидроксильной группы - не в третьем положении, а во втором.
86. -К Е Т О Г Л У Т А Р А Т - это соединение, у которого 5 С, две группы -СООН, кетогруппа во втором положении. Точнее, это анион такого соединения.
87. С У К Ц И Н И Л К о А - это соединение сукцинила (остатка сукцината) и кофермента А, соединенных сложноэфирной связью (которая в этом случае является макроэргической). Остаток сукцината - это сукцинат без ОН атомов одной из карбоксильных групп.
88. С У К Ц И Н А Т - это анион янтарной кислоты, у которой 4 С, 2 - СООН.
89. Ф У М А Р А Т - анион фумаровой кислоты, которая отличается от сукцината отсутствием одного атома водорода во втором положении и одного - в третьем. (А между вторым и третьим атомами углерода есть двойная связь).
При двойной связи - транс-конфигурация.
90. М А Л А Т - это анион яблочной кислоты, у которой 4 С, две - СООН группы и одна гидроксильная группа (при С 2).
91. Ц И Т Р А Т Л И А З А - это фермент, который может катализировать превращение цитрата в ацетилКоА (для использования ацетилаКоА для синтеза липидов).
92. Р Е Г У Л Я Т О Р Н Ы Е М Е Т А Б О Л И Т Ы Ц Т К - это метаболиты ЦТК, которые могут регулировать активность других процессов.
К регуляторным метаболитам относятся цитрат, ацетилКоА и НАДН.
Цитрат ингибирует гликолиз и активирует синтез жирных кислот, ацетилКоА ингибирует ПДГ и активирует Глюконеогенез, НАДН ингибирует процессы окислительно катаболизма, кроме ДЦ.
93. РЕГУЛЯЦИЯ ХИМИЧЕСКИХ РЕКЦИЙ МЕТАБОЛИЧЕСКОГО ПУТИ - это изменений скорости химических реакций (увеличение или уменьшение).
Обычно - посредством изменения активности ферментов (ключевых), которые катализируют эти химические реакции.
С целью приспособления скорости химических реакций к потребностям организма.
94. А К Т И В А Ц И Я - это увеличение скорости химической реакции, за счет увеличения активности молекул фермента.
95. А К Т И В А Т О Р - это вещество, которое активирует фермент.
96. И Н Г И Б И Р О В А Н И Е - это уменьшение скорости химической реакции, за счет уменьшения активности молекул фермента.
97. И Н Г И Б И Т О Р - это вещество, которое ингибирует фермент (то есть уменьшает активность фермента).
98. И Н Д У К Ц И Я - это увеличение количества (концентрации) молекул фермента (или другого белка), обычно за счет увеличения синтеза молекул фермента.
99. И Н Д У К Т О Р - это вещество, под действие которого происходит индукция.
100. Р Е П Р Е С С И Я - это уменьшение количества (концентрации) молекул фермента (или другого белка), обычно за счет уменьшения синтеза молекул фермента.
101. Р Е П Р Е С С О Р - это вещество, под действие которого происходит репрессия.
102. ОТРИЦАТЕЛЬНАЯ ОБРАТНАЯ СВЯЗЬ - это означает, что результат процесса тормозит скорость процесса. По отношению к метаболизму это означает, что продукт химической реакции (или метаболического пути) снижает скорость химической реакции (за счет снижения активности фермента под действием продукта). Примеры далее.
103. ИНГИБИРОВАНИЕ ПО ПРИНЦИПУ ОТРИЦАТЕЛЬНОЙ ОБРАТНОЙ СВЯЗИ - это означает, что продукт химической реакции (или метаболического пути) снижает скорость химической реакции, за счет снижения активности фермента под действием продукта, то есть за счет ингибирования. Примеры далее.
При этом - продукт реакции снижает скорость химической реакции (или нескольких реакций), за счет которой образуется, тогда, когда продукта уже много.
104. ИНГИБИРОВАНИЕ ГЛИКОЛИЗА ЦИТРАТОМ - гликолиз ингибируется цитратом потому, что цитрат образуется из продукта гликолиза пирувата, но НЕ непосредственно - сначала из пирувата образуются ацетилКоА и оксалоацетат, а уже из оксалоацетата и ацетилКоА образуется цитрат.
Принцип регуляции - ингибирование продуктом, отрицательная обратная связь.
105. АКТИВАЦИЯ ЦИТРАТОМ СИНТЕЗА ЖИРНЫХ КИСЛОТ - из цитрата образуется ацетилКоА, из которого синтезируются жирные кислоты. То есть фактически цитрат является исходным субстратом для синтеза жирных кислот. А субстраты обычно активируют процессы, в которых используются.
106. ИНГИБИРОВАНИЕ ПДГ ацетиломКоА - ацетилКоА является продуктом ПДГ, и "по праву" продукта ингибирует ПДГ (по принципу отрицательной обратной связи).
107. Г Л Ю К О Н Е О Г Е Н Е З - это название синтеза глюкозы из пирувата, в основном (а также - из промежуточных метаболитов глюконеогенеза и из всего, что может превратиться в пируват)
108. АКТИВАЦИЯ ГНГ ацетиломКоА - ацетилКоА увеличивает скорость глюконеогенеза, причем ацетилКоА является ОБЛИГАТНЫМ, то есть обязательным активатором глюконеогенеза.
109. О К И С Л И Т Е Л Ь Н Ы Й К А Т А Б О Л И З М - это процессы катаболизма, которые сопровождаются окислением субстратов.
Таких процессов большинство в катаболизме. В основном, к ним относятся процессы второго и третьего этапов катаболизма. Примеры - ЦТК, -окисление жирных кислот и другие.
110. ИНГИБИРОВАНИЕ ОКИСЛИТЕЛЬНОГО КАТАБОЛИЗМА КОФЕРМЕНТОМ НАДН (то есть восстановленной формой кофермента) - это означает, что процессы окислительного катаболизма ингибируются НАДН.
НАДН ингибирует процессы окислительного катаболизма в качестве продукта этих процессов, то есть по принципу отрицательной обратной связи
111. В И Т А М И Н Ы Ц Т К - это витамины, которые необходимы для работы ЦТК.
К ним относятся 5 витаминов - В1, В2, РР, пантотенат и липоевая кислота.
Эти витамины входят в состав коферментов ЦТК, а это значит, что без этих витаминов ферменты ЦТК работать не смогут, то есть реакции ЦТК почти остановятся.
В результате дефицит витаминов ЦТК может привести к дефициту АТФ, к снижению синтеза глюкозы, аминокислот (белков).
112. К О Ф Е Р М Е Н Т Ы Ц Т К - это коферменты, которые необходимы для работы ферментов ЦТК.
К коферментам ЦТК относятся 5 - ТПФ, ФАД, НАД+, КоА и липоевая кислота.
113. Н И К О Т И Н А М И Д - витамин, который входит в состав коферментов НАД+ и НАДФ+ (и их восстановленных форм, то есть НАДН и НАДФН).
Обозначается РР, что означает Против Пеллагры, то есть против заболевания пеллагра, которое возникает при дефиците витамина РР (никотинамида).
114. РР - см. никотинамид.
115. П Е Л Л А Г Р А - в переводе означает шершавая кожа, то есть дерматит. Но так называют не любой дерматит, а тот, который возникает из-за дефицита коферментов НАД+ и НАДФ+ (и их восстановленных форм).
Причиной дефицита этих коферментов является дефицит в пище витамина РР. И белков, содержащих триптофан (так как из триптофана тоже может синтезироваться НАД+).
При этом, кроме дерматита, есть еще такие симптомы, как диарея и деменция (нарушение умственной деятельности - бред, галлюцинации ит.д.).
Из-за сочетания трех симптомов, названия которых начинаются на букву Д, пеллагру называют болезнью трех Д.
Дефицит витамина называется гиповитаминозом, а отсутствие - гиповитаминозом. Поэтому можно сказать, что пеллагра - это авитаминоз РР. Так же, как цинга - это авитаминоз витамина С.
116. Р И Б О Ф Л А В И Н - это витамин, который входит в состав кофермента ФАД (и его восстановленной формы, то есть ФАДН2).